Die FSME darf nicht verwechselt werden mit einer anderen, durch Zecken übertragenen Erkrankung: der Lyme-Borreliose. Dabei handelt es sich um eine durch Bakterien ausgelöste Erkrankung, die sich Tage bis Wochen nach dem Stich mit ersten Symptomen bemerkbar macht. Die Beschwerden können über mehrere Jahre anhalten. Bei rechtzeitiger Diagnose ist die Borreliose allerdings gut heilbar.

Die FSME (Frühsommer-Meningoenzephalitis) ist eine Form der Hirn- beziehungsweise Hirnhaut- und manchmal auch Rückenmarksentzündung und wird durch das FSME-Virus ausgelöst.

Der Erreger wird durch Zecken auf den Menschen übertragen, die Erkrankung tritt hauptsächlich in den Sommermonaten auf. Eine Infektionsgefahr besteht nur in Gebieten, wo Zecken mit dem FSME-Virus infiziert sind. Hierzulande sind dies besonders Wald- und Wiesengebiete in Süddeutschland.